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賽默飛Qubit 4.0熒光計檢測出的濃度比預期高(或者比其他方法如Nanodrop高),通常不是儀器本身故障或誤差,而是由于其獨特且高度特異的工作原理以及樣品本身的性質造成的。以下是導致Qubit 4.0檢測濃度“偏高"的幾個主要原因,按重要性排序:
一、核心原因:檢測原理的根本不同 (最關鍵的一點)
1、Qubit 4.0 - 特異性熒光檢測:
Qubit使用一種只有與特定目標分子(如dsDNA、RNA、蛋白質) 結合后才會發出強烈熒光的染料。
染料不會與蛋白質、游離核苷酸、鹽離子、溶劑或其他常見污染物結合并發光。
結果:Qubit只報告您想要測量的特定目標分子的濃度。它幾乎忽略了所有雜質。
2、其他方法(如Nanodrop) - 紫外吸光度(UV Absorbance):
Nanodrop基于260nm波長下的吸光度原理。任何在該波長下能吸光的物質都會貢獻讀數。
這包括:dsDNA, ssDNA, RNA, 游離核苷酸, 蛋白質, 苯酚, 胍鹽等常見污染物。
結果:Nanodrop報告的是樣品中所有吸光物質的總和,通常會高估純凈目標分子(如dsDNA)的實際濃度。
結論:當您說Qubit濃度“更高"時,很可能是在與Nanodrop對比。在大多數情況下,Qubit的結果更準確,而Nanodrop因為包含了雜質的信號而虛高了。Qubit顯示的是“有效濃度",而Nanodrop顯示的是“總吸光物質濃度"。
二、使用了錯誤的標準曲線或試劑
Qubit的精確度極度依賴于使用正確的、新配制的標準品來生成校準曲線。
1、使用了錯誤的 assay:例如,您想測的是RNA,但錯誤地選擇了“dsDNA HS"檢測程序。不同assay的染料和標準曲線不同,交叉使用會導大的誤差。
2、標準品降解或污染:標準品如果反復凍融、保存不當或過期,其濃度會不準,導致繪制的標準曲線斜率錯誤,從而使所有未知樣品的計算結果產生系統偏差(可能偏高也可能偏低)。
3、標準品稀釋錯誤:制備工作液時,必須嚴格按照說明書操作。如果加入的染料太多或標準品量不準,都會影響結果。
三、樣品本身的問題
1、含有干擾熒光讀數的物質:雖然Qubit染料特異性很強,但高濃度的某些污染物(如某些去垢劑)可能會影響熒光本身,導致讀數異常。
2、樣品超出檢測范圍:每個Qubit assay都有其線性范圍(如dsDNA HS assay是0.2-100 ng)。如果您的樣品濃度遠高于上限,即使儀器自動稀釋,也可能因進入非線性區域而導致計算結果不準確。務必確認樣品濃度落在所用assay的推薦范圍內。
四、總結與建議
當您發現Qubit 4.0濃度偏高時,請遵循以下排查流程:
1、首先確認對比對象:如果是在與Nanodrop對比,通常信任Qubit的結果。它的特異性更強,結果更可靠,尤其對于純度不高的樣品。
2、雙重檢查實驗流程:
我是否選擇了正確的檢測程序?(dsDNA, RNA, Protein等)
我使用的標準品和染料工作液是否新配制?是否在有效期內?
我是否讓反應液孵育了足夠長的時間(至少2分鐘)?
我是否擦拭了試管?
3、檢查樣品狀態:我的樣品濃度是否在** assay的線性范圍**內?如果過高,請用緩沖液進行稀釋后重新測量。
4、運行診斷:Qubit 4.0儀器本身通常很穩定。如果懷疑儀器問題,可以運行內置的“性能驗證"(Performance Verification)測試,使用隨機的驗證板來確認儀器和探頭的功能是否正常。
絕大多數情況下,濃度“偏高"的現象根源在于Qubit更高的特異性凸顯了其他方法(如紫外吸光度)的誤差。